Том 20, № 1

Проблемы здоровья и экологии. – 2023. – Т. 20, № 1. – 160 с.

Sun, 01 Jan 2023 00:00:00 GMT

Проблемы здоровья и экологии. – 2023. – Т. 20, № 1. – 160 с. ГомГМУ

Проблемы здоровья и экологии. – 2023. – Т. 20, № 1. – Содержание.

Sun, 01 Jan 2023 00:00:00 GMT

Проблемы здоровья и экологии. – 2023. – Т. 20, № 1. – Содержание. ГомГМУ

Молекулярно-генетические маркеры резистентности и вирулентности инвазивных штаммов Klebsiella pneumoniae по данным полногеномного секвенирования

Sun, 01 Jan 2023 00:00:00 GMT

Молекулярно-генетические маркеры резистентности и вирулентности инвазивных штаммов Klebsiella pneumoniae по данным полногеномного секвенирования Бонда, Н. А.; Стома, И. О.; Осипкина, О. В.; Зятьков, А. А.; Шафорост, А. С.; Карпова, Е. В.; Тапальский, Д. В. Цель исследования. С использованием полногеномного секвенирования оценить генетические механизмы антибиотикорезистентности и вирулентности инвазивных штаммов Klebsiella pneumoniae, выделенных от госпитализированных пациентов. Материалы и методы. Для двух устойчивых к карбапенемам множественно-антибиотикорезистентных инвазивных штаммов K. pneumoniae, а также двух чувствительных к карбапенемам инвазивных штаммов K. pneumoniae выполнено секвенирование в геномном секвенаторе MiSeq (Illumina). Проведена сборка геномных последовательностей и их аннотация. Выполнено определение сиквенс-типа, поиск плазмид и факторов вирулентности, генов антибиотикорезистентности и механизмов эффлюкса. Результаты. Штаммы K. pneumoniae относились к сиквенс-типам ST395, ST101, ST111, ST512 и имели гипермукоидный фенотип. Гены аэробактина iutA были обнаружены как у чувствительных, так и у резистентных к карбапенемам штаммов. У одного выделенного из крови штамма выявлены гены вирулентности fimH, fyuA, irp2. У двух штаммов выявлены гены карбапенемаз (blaKPC, blaNDM). Гены устойчивости к аминогликозидам и фторхинолонам выявлены у трех из четырех штаммов. У всех штаммов отмечено присутствие различных систем активного выведения антибиотиков из микробной клетки. Заключение. Показана возможность идентификации гипервирулентных штаммов K. pneumoniae при комплексном использовании фенотипического теста наряду с генотипированием hvKp. Результаты полногеномного секвенирования отражают значительную устойчивость выделенных из крови гипермукоидных штаммов K. pneumoniae к большинству антибиотиков, включая β-лактамы, аминогликозиды, фторхинолоны, фосфомицин, хлорамфеникол, полимиксины.; Objective. To evaluate genetic mechanisms of antibiotic resistance and virulence of invasive strains of Klebsiella pneu- moniae isolated from inpatients using whole genome sequencing. Materials and methods. For two carbapenem-resistant multiple-antibiotic-resistant invasive strains of K.pneumoniae, as well as two carbapenem-sensitive invasive strains of K.pneumoniae, sequencing was performed using the MiSeq genomic sequencer (Illumina). Genomic sequences were assembled and annotated. Sequence type determination, search for plasmids and virulence factors, antibiotic resistance genes, and efflux mechanisms were performed. Results. K.pneumoniae strains belonged to sequence types ST395, ST101, ST111, and ST512 s and had a hypermu- coid phenotype. The iutA aerobactin genes were detected in both sensitive and carbapenem-resistant strains. Virulence genes fimH, fyuA, and irp2 were detected in one strain isolated from blood. Carbapenemase genes (blaKPC, blaNDM) were detected in two strains. Aminoglycosides and fluoroquinolones resistance genes were detected in 3 of 4 strains. All strains showed the presence of different systems of active antibiotic elimination from the microbial cell. Conclusion. The possibility of identifying hypervirulent strains of K.pneumoniae using a complex phenotypic test along with hvKp genotyping is shown. The results of full-genome sequencing reflect significant resistance of hypervirulent K.pneumoniae strains isolated from blood to most antibiotics, including β-lactams, aminoglycosides, fluoroquinolones, phosphomycin, chloramphenicol and polymyxins.

Цитологический метод исследования в диагностике уринарной патологии при циррозе печени

Sun, 01 Jan 2023 00:00:00 GMT

Цитологический метод исследования в диагностике уринарной патологии при циррозе печени Малаева, Е. Г.; Зайцева, Л. П.; Князюк, А. С.; Осипкина, О. В. Цель исследования. Определить возможности цитологического метода исследования клеточного осадка мочи для диагностики и дифференциальной диагностики патологии почек и мочевыводящих путей при циррозе печени. Материалы и методы. Проведено стандартное обсервационное исследование 50 госпитализированных пациентов с циррозом печени. Цитологические препараты осадка мочи были приготовлены методами жидкостной цитологии и цитоцентрифугирования и после фиксации окрашены по Романовскому – Гимза, Папаниколау, Граму. Результаты. При цитологическом исследовании клеточного осадка мочи у госпитализированных пациентов с циррозом печени в 31 % случаев выявлены дисморфичные (выщелоченные) эритроциты, статистически значимо чаще у пациентов с декомпенсацией заболевания и 30-дневной летальностью (р < 0,05). У 63 % пациентов обнаружена микрофлора в моче, чаще смешанного характера (27 %). У 46 % пациентов с декомпенсированным циррозом печени, в том числе с острым почечным повреждением, цитологический препарат мочевого осадка представлен многоклеточными элементами с наличием уротелия поверхностных и глубоких слоев, почечного эпителия. Заключение. Цитологический метод исследования клеточного осадка мочи — доступный, информативный, недорогой метод диагностики, возможностями которого является обнаружение, характеристика и дифференцировка клеточных элементов (уротелий поверхностных и глубоких слоев, почечный эпителий, выщелоченные эритроциты), микрофлоры и ее источника (генитального тракта, мочевых путей), что в совокупности с другими методами позволяет верифицировать диагноз пациента и проводить дифференциальную диагностику острого тубулярного некроза и гепаторенального синдрома.; Objective. To determine the possibilities of cytological method of urine cellular sediment examination for diagnosis and differential diagnosis of renal and urinary tract pathology in liver cirrhosis. Materials and methods. A standard observational study of 50 inpatients with liver cirrhosis was performed. Cytological preparations of urine sediment were prepared by liquid cytology and cytocentrifugation methods and after fixation were stained by Romanowsky-Giemsa, Papanikolau (Pap) and Gram. Results. Cytological study of cellular urine sediment in hospitalized patients with cirrhosis revealed dysmorphic (leached) erythrocytes in 31% of cases, statistically significantly more frequently in patients with decompensation of the disease and 30-day mortality (p<0,05). Microflora in the urine was found in 63% of patients, more often of mixed nature (27%). In 46% of patients with decompensated liver cirrhosis, including acute renal injury, cytological preparation of urinary sediment is represented by multicellular elements with the presence of superficial and deep urothelium and renal epithelium. Conclusions. Cytological method of studying the cellular urine sediment is an accessible, informative and cheap diagnostic method, the possibilities of which are to determine the presence and origin of cellular elements (urothelium of the surface and deep layers, altered erythrocytes), microflora and its source (genital tract, urinary tract), which, in combination with other methods, allows to verify the diagnosis of the patient and to carry out differential diagnosis of acute tubular necrosis and hepatorenal syndrome.